通常合同分析首先針對具體的合同條款（或合同結(jié)構(gòu)中的子項）。根據(jù)它的表達方式，分析它的執(zhí)行將會帶來什么問題和后果。在此基礎上還應注意合同條款之間的內(nèi)在聯(lián)系。同樣一種表達方式，在不同的合同環(huán)境中，有不同的上下文，則可能有不同的風險。

由于合同條款所定義的合同事件和合同問題具有一定的邏輯關(guān)系（如實施順序關(guān)系，空間上和技術(shù)上的互相依賴關(guān)系，責任和權(quán)力的平衡和制約關(guān)系，完整性要求等），使得合同條款之間有一定的內(nèi)在聯(lián)系，共同構(gòu)成一個有機的整體，即一份完整的合同。例如：

有關(guān)合同價格方面的問題涉及：合同計價方法、量方程序、進度款結(jié)算和支付、保留金、預付款、外匯比例、竣工結(jié)算和最終結(jié)算、合同價格的調(diào)整條件、程序、方法等。

工程變更問題涉及：工程范圍，變更的權(quán)力和程序，有關(guān)價格的確定，索賠條件、程序、有效期等。

它們之間互相聯(lián)系，構(gòu)成一個有機的整體。通過內(nèi)在聯(lián)系分析可以看出合同中條款之間的缺陷、矛盾、不足之處和邏輯上的問題等。