國家土地督察行政編制360名。機構設置為國家土地總督察及其辦公室，向地方派駐9個國家土地督察局，分別是國家土地督察北京局、沈陽局、上海局、南京局、濟南局、廣州局、武漢局、成都局、西安局。

國家土地督察北京局，督察范圍為：北京市、天津市、河北省、山西省、內蒙古自治區(qū)；

國家土地督察沈陽局，督察范圍為：遼寧省、吉林省、黑龍江省及大連市；

國家土地督察上海局，督察范圍為：上海市、浙江省、福建省及寧波市、廈門市；

國家土地督察南京局，督察范圍為：江蘇省、安徽省、江西�。�

國家土地督察濟南局，督察范圍為：山東省、河南省及青島市；

國家土地督察廣州局，督察范圍為：廣東省、廣西壯族自治區(qū)、海南省及深圳市；

國家土地督察武漢局，督察范圍為：湖北省、湖南省、貴州省；

國家土地督察成都局，督察范圍為：重慶市、四川省、云南省、西藏自治區(qū)；

國家土地督察西安局，督察范圍為：陜西省、甘肅省、青海省、寧夏回族自治區(qū)、新疆維吾爾自治區(qū)、新疆生產建設兵團。

國家土地督察機構設總督察1名，由國土資源部部長兼任；兼職副總督察1名，由國土資源部1名副部長兼任；專職副總督察（副部長級）1名。國家土地總督察辦公室設主任1名，副主任2名。每個國家土地督察局設局長1名、副局長2名和國家土地督察專員若干名。